总管国际标准书号的机构是设在德国柏林国立普鲁士文化遗产图书馆（Staatsbibliothek zu Berlin - Preußischer Kulturbesitz）的国际标准书号管理局（International ISBN Agency）。该机构的主要工作之一是向下一级地区机构分配地区号码。一般的地区机构都设在国家图书馆内，但是一些大的国家和地区却不是这样。例如，英国的地区机构是惠特克公司（Whitaker），该公司在国际标准书号尚未问世前，就是英国的国家书号中心，可以说是国际标准书号的先驱；美国的地区中心是鲍克公司（R. R. Bowker）；我国的地区机构设在新闻出版署。地区机构的主要工作是接受出版社的申请，批给第二段号码，即出版社的代码。第三个号码和校验码就由出版社自己决定了。
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